2014.11.17,24 NCBI Blast & Biology work-bench & UCSC Genome Browser

一. NCBI Blast 可搜尋未知的基因序列

1.輸入基因序列在上方紅色框中,下方紅色框中可以選取物種,若不知可以選others,也可選取想要在哪個資料庫搜尋

B1

2.搜尋結果

B2

 

B3

二. Biology work-bench 搜尋可以比較不同基因序列的差異以及物種親緣關係

1.首先先註冊,之後登入work-bench,按Nucleic Tools

w1

2.先新增所要分析的基因序列

w2

兩種方法: 上傳檔案 或 將基因序列複製貼上並打上標題新增可以分析的檔案

w3

3.選取CLUSTALW – Multiple Sequence Alignment,勾選以下新增好的基因序列檔案

w4

進行分析…

4.搜尋結果

w r1 w r2

三. UCSC Genome Browser  可以做不同物種的某段基因序列比對

1.先用NCBI找尋基因的Locus碼

u

2.在UCSC Genome Browser輸入基因的Locus碼進行搜尋

U1

u3 在search term輸入

3.搜尋結果

U r

 

 

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