12.22 Homework

 

下載MEGA軟體後,以分析family tree

選擇一種植物-蘭科作為搜尋目標

圖片9

以RBCL基因做搜尋(植物廣泛表現的基因產生葉綠素)

選擇十個以上的基因序列,以FASTA格式下載

圖片8

將下載的檔案,以MEGA軟體開啟

圖片23

將其他前後無法配對的序列刪除

圖片21圖片22

 

選擇Alignment後,排列結果如下

 

圖片25

以不同顏色,觀察基因序列

圖片10

接著另外進行Neighbor-Joining Tree分析

圖片12圖片11

 

Neighbor-Joining Tree 結果圖

圖片13

Maximum Parsimony Tree 分析結果圖

圖片20

 

可以挑選其中的一條演化分支,接著選擇Place root on branch

觀察此分支與其他的差異

 

圖片19  圖片14

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