11.25 Homework

一. NCBI Blast

找到目標基因CDKN2A

點進FASTA

圖片26

複製序列

圖片27

以BLAST分析

圖片28

結果圖一

圖片29

結果圖二

選取三個基因序列

圖片30

 

二. Biology work-bench

進入Biology WorBench頁面

圖片31

註冊登入後,選Nucleic Tools

圖片32

 

點選ADD按鈕後,將前面選擇的三個基因加入

 

圖片33

選擇加入的三個基因,按CLUSTALW

圖片34

取消上方的Run in batch

相同頁面下方Run in batch也取消後,按Submit

(因為頁面顯示與其他人不同,所以以不同的過程進行)

圖片36 圖片37

結果圖一

圖片38

結果圖二,可以知道三個基因彼此的接近程度

圖片39

三. ePCR-ucsc genome browser

到NCBI找CDKN2A的locus編碼

圖片41

 

到UCSC後,點選genome browser

圖片40

 

輸入先前查詢到的locus編碼

 

 

 

圖片42

結果圖

圖片43

 

發佈留言

發佈留言必須填寫的電子郵件地址不會公開。