MEGA & Phylogenetic tree

1.下載MEGA

圖片1

2.找一個植物的物種 (ex:Arecaceae 棕櫚科)

3.至NCBI,選nucleotide,關鍵字搜尋”Arecaceae rbcl” (rbcl為基因名)

圖片2

4.任意勾選10個結果,並儲存成FASTA檔

圖片3

5.打開MEGA後開啟FASTA檔

1)將序列Alignment

圖片4

2)將FASTA轉檔

圖片5

5.分析:1)Neighbor-Joining Tree

2)Maximum Parsimony Tree

*要選Bootstrap method

1)

圖片6

圖片7

圖片8

2)

圖片9

圖片10

圖片11

3.選一個物種Place Root Branch

圖片12

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